三、基因測序公司（NGS）的發展方向：測序是起點而不是終點

　　如果是基因測序產業上游的公司，產品銷售的目標客戶廣泛，橫跨科研、醫療、商檢領域，產品包括測序儀、DNA提取試劑盒、捕獲試劑盒/多重子擴增試劑盒、建庫試劑盒、上機測序試劑盒，其中測序儀、上機測序試劑盒兩者是綁定的，DNA提取試劑盒、捕獲試劑盒/多重子擴增試劑盒、建庫試劑盒是可以用第三方的產品，國內企業可以從這三個方向切入，但是試劑盒中的最關鍵的工具酶以及分離材料等都還是以進口產品為主，壁壘較高，如果能實現這兩個產品的進口替代，說明企業具有較強的技術實力。

　　在科研和商檢領域，試劑盒的審批門檻較低，但是需要提供定制化服務；在醫療診斷領域，多基因的捕獲試劑盒/多重子擴增試劑盒不大可能通過CFDA審批（前面已經說明原因），只有通過認證的臨檢實驗室才能夠以自制試劑使用，因此這部分企業（思路迪、世和基因、燃石生物等）需要做兩手準備，籌備建設臨檢中心，向服務端布局。

　　測序是起點而不是終點，做中游測序服務的機構，最大的市場還是在醫療診斷領域，除了通過提供服務獲得收益外，測序機構最大的潛在優勢是能夠獲得特殊患者的組織樣本，并且獲得基因數據的積累，這對于藥物開發是十分便利的條件。

　　比如說，腫瘤患者在使用某靶向藥物后出現耐藥性，測序機構通過基因測序發現了新的耐藥位點（這是PCR、基因芯片這種檢測已知突變位點的技術所不具備的優勢），那么這個位點就是下一款靶向藥物的開發方向，并且測序機構還可以獲得患者的腫瘤組織，以此培養原代細胞株，作為藥物開發的細胞模型，這就比其他的藥物研發機構擁有更多的先發優勢。

　　我個人看好思路迪的發展模式，以自己的測序服務為橋梁，打通患者、醫院、CRO企業，測序結果提供用藥指導，同時反過來鏈接下游藥物開發和臨床試驗，形成良好的反饋機制。

　　案例（美國腫瘤測序公司Foundation Medicine）：

　　Foundation Medicine是一家專注于腫瘤高通量測序的商業公司，該公司專有的平臺可產生對病人的個體癌癥可操作的基因組信息，使醫生能夠在臨床實踐中優化治療，使生物制藥公司制定有針對性的癌癥療法更加有效。

　　該公司以二代基因測序技術為基礎，根據癌癥基因測序結果給腫瘤患者提供精準的用藥指南。該公司的基因測序技術能夠發現導至患者罹患癌癥的基因突變，讓“個體化用藥”走進了新領域，讓醫生能夠根據患者的遺傳信息進行有針對性的癌癥治療。

　　Foundation Medicine的服務需要醫生訂購，患者只需提供10余個病例組織切片或者一管幾毫升的血液。從提取腫瘤細胞的DNA到最終的報告，持續時間14-21天，其中包含了檢測出來的癌癥基因突變情況，以及針對每一種突變基因給出的用藥指導建議。

　　Foundation Medicine提供兩種產品，FoundationOne和FoundationOne Heme。兩種產品均是以二代基因測序為基礎，使用的測序儀包括Illumina HiSeq 2000 system和 Life Technologies' Ion Torrent。FoundationOne檢測適用于所有實體瘤，檢測315個癌癥相關基因的編碼區域以及28個基因的內含子重排，費用為$5800。FoundationOne Heme檢測針對血液惡性疾病、淋巴瘤、白血病等，檢測405個基因的編碼區序列和31個基因的內含子重排，以及265個基因的RNA序列來檢測基因融合，費用為$7200。FoundationOne檢測的方法在2013年10月時發表在了Nature Biotechnology上。

　　進行癌癥基因測序檢測需要癌癥基因的數據庫，公司因而建立了數據庫FoundationCORE。公司在2014年12月推出了瀏覽器ICE 2，該瀏覽器的一大特點是“患者匹配”功能。臨床醫生可以通過它在已有的知識庫FoundationCORE中搜索，尋找與患者腫瘤基因組類似的其他患者的信息。ICE 2的一個新的組成部分是PatientMatch，是一種利用FoundationCORE來增加FoundationOne和 FoundationOne Heme使用率的技術工具。通過PatientMatch，使用ICE 2網絡的醫生可以與在治療具有類似基因資料病人的醫生相聯系，和他們分享診斷結果合治療方案。根據公司2015年第三季度的報告，FoundationCORE已包含6萬個臨床病例信息。

　　Foundation Medicine一直在努力的一個領域是醫保問題。2014年，密歇根州的大溪城重點衛生部門宣布把Foundation Medicine的癌癥基因組分析服務納入醫保范圍；Google表示谷歌公司將該公司的癌癥基因的DNA檢測服務，作為其員工福利計劃的一部分。Foundation Medicine還通過了McKesson診斷交易所和美國國家綜合癌癥網絡的認可，能夠對非小細胞肺癌進行全基因組檢測，并且收到了獨特的Z-code標識符。此外，Foundation Medicine首席財務官Jason Ryan表示，醫保范圍不僅在肺癌中逐步擴大，還將會逐步涉及到其他疾病服務。

　　Foundation Medicine的營業收入主要來自兩個方面，一個是來自生物制藥公司，另一個是來自臨床診斷。2015年第三季度，來自生物制藥公司的收入為1170萬美元，與去年同期相比增長75%；來自臨床診斷的收入為1370萬美元，與去年同期相比增長40%，營收增長非常明顯。